DIN EN ISO 23418:2022-09

In der Lebensmittelindustrie besteht ein Interesse an der Gesamtgenomsequenzierung (WGS, englisch: Whole Genome Sequencing) zur Charakterisierung von Bakterienisolaten aus ausgelagerten Zutaten und Oberflächen aus der Umwelt, um deren Herkunft und Ökologie besser zu verstehen und Verfahren zur Risikominderung zu aktualisieren. Dieses Dokument soll sowohl für die Labor- als auch für die bioinformatischen Komponenten des WGS und die zugehörigen Metadaten für lebensmittelbedingte Mikroorganismen als Leitfaden dienen. Die Anforderungen lassen sich unabhängig von maschinellen und chemischen Bedingungen anwenden und umfassen: - die Bearbeitung der Bakterienkulturen, - die Isolierung der genomischen DNA, - die Vorbereitung der genomischen DNA-Bibliothek, sowie - die Sequenzierung der genomischen DNA. Sie umfassen weiterhin die Beurteilung von Rohdaten und deren Qualität, der Qualität des Sequenzierungsvorgangs und das geeignete Vorgehen beim Speichern der Datensätzen. Ferner beinhaltet die Norm Anforderungen für die bioinformatische Auswertung von Sequenzierungsdaten. Für diese Norm ist der Arbeitsausschuss NA 057-01-06 AA „Mikrobiologie der Lebensmittelkette“ im DIN-Normenausschuss Lebensmittel und landwirtschaftliche Produkte (NAL) zuständig.